PHP tokenizer использует свои внутренние структуры интерпретатора PHP и работает быстро, т.к. написан на C. А вот чисто питонья библиотека будет работать намного медленнее. Библиотека для питона, написанная на С, для разбора PHP — мне кажется, что будет очень сложно найти что-то похожее.
Почему бы не поднять fcgi с php, не делать разбор там и отдавать результаты питону в виде JSON?
My<cod/>.net
